コンフィグ用シェルスクリプトを用意
apache.configure

#!/bin/sh
./configure \
--enable-module=so \
--enable-mods-shared=most \
--enable-ssl \
--with-ssl=/usr/share/ssl \
--enable-vhost-alias

apache.configure

make
make install

make clean
make distclean

確か1でも2でもいけるはず…

アップグレードでの再インストールの場合、設定ファイル・ドキュメントファイルは上書きされませんが、
ドキュメントルートのindex.htmlやapacheアイコンなどは上書きされます。